Die kollegiale Leitung, bestehend aus zwei Professorinnen oder Professoren der Universität Passau, wird von der Universitätsleitung berufen. Die Amtszeit der Leitung beträgt vier Semester. Sie ist insbesondere verantwortlich für die strategische und konzeptionelle Entwicklung des PICAIS, die Leitung der Auswahlsitzungen für die Vergabe von Fellowships und Veranstaltungsförderungen sowie für den Einsatz des beim PICAIS tätigen Personal. Sie legt der Universitätsleitung regelmäßig einen Entwicklungsplan vor und berichtet über die Tätigkeiten und Ziele des PICAIS.
Die kollegiale Leitung wird durch eine Geschäftsstelle unterstützt. Die Besetzung der Stelle der Geschäftsführerin oder des Geschäftsführers erfolgt im Einvernehmen mit der Universitätsleitung. Die Geschäftsführerin oder der Geschäftsführer vollzieht die Beschlüsse der kollegialen Leitung und des Boards, führt die laufenden Geschäfte des PICAIS und berichtet der kollegialen Leitung und der Universitätsleitung regelmäßig.
Die Geschäftsstelle des PICAIS befindet sich in der Nikolastraße 12 in den Räumen 112-114 und ist derzeit über die Geschäftsführerin Dr. Stefanie Meister (stefanie.meister@uni-passau.de) oder per E-Mail an picais-office@uni-passau.de erreichbar.